Они имеют право нанести ущерб машине злоумышленника? (разбить окно или стрелять в колеса) ?

Ст. 23 фз "о полиции"

сотрудник полиции также имеет право применять огнестрельное оружие:

1) для остановки транспортного средства путем его повреждения, если управляющее им лицо отказывается выполнить неоднократные требования сотрудника полиции об остановке и пытается скрыться, создавая угрозу жизни и здоровью граждан;

судя по всему имеют право.